Пример такой программы? У меня почему-то стойкое мнение, что перепрошивка убивает все. Или это касается конкретной модели телефона? Если так, то какой?

Неверное мнение. Пример-лоченые телефоны, При перепрошивке они не анлочатся.

Загрузчик, firmware, радио и тому подобное, в прошивках не содержатся и, соответственно, не трогаются при перепрошивке.

Никогда не имел дело с лочеными телефонами. Но на своих Андроид телефонах перепрошивал все: загрузчик, радио и саму прошивку.

К сожалению это не так. Есть однофайловые прошивки, которые изменяют только систему, также есть 3 и 4 файловые которые меняют всё включая регион и даже имеется возможность смены имея. Программы "защищающие" андроид, расчитаны на обыденную утерю или на неопытных воров гопников, что само по себе редкость. Все скупщики краденого прекрасно осведомлены о этом.

В мире есть не только самсунги. Для hTC, Huawei и огромной массы ещё, "многофайловые" прошивки-это смех :-)
Кстати, разлочить операторский самсунг, прошивкой, попробуйте :-)

Прошу прощения, Вы правы, не всё так просто, даже с тем же самсунгом. В действительности, достаточно много подводных камней, при перепрошивке. Самое важное, что имей сменить на современных трубках, большая проблема.

Незнаю как сейчас обстоять дела для HTC, но во врмена HTC Hero, Desire смехом и не пахло. :-)
Все же склонюясь к мнению, что нужно говорить о конкретной(ых) модели(ях).

За ТРИ года-многое поменялось. Но, смехом пахло.
Прошивку со сменой hboot, radio или просто firmware, слёту на Desire, не подскажете? :)

Как только вы написали про hboot, до меня дошло.
Извиняюсь, я говорил про recovery, radio и саму ОС.

Чтобы поставить кастом прошивку на Desire (не лоченную), нужно было получать root. Дальше прошивался кастом рикаври (например, amonra) и через amonra прошивался radio или os.

Bootloader менял только на Nexus. Не знаю возможно ли это проделать и для других телефонов.